В зону ответственности Красноярского филиала («НИИЭРВ») входит Енисейский рыбохозяйственный район Западно-Сибирского рыбохозяйственного бассейна, который расположен на территории трех субъектов Российской Федерации: Красноярского края, Республик Тыва и Хакасия.